MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 43083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020834	ACG	2	6	180023	180028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335422
3002	NC_020834	TGAAGA	2	12	180030	180041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	472335422
3003	NC_020834	GTGGCG	2	12	180043	180054	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	472335422
3004	NC_020834	TGG	2	6	180107	180112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335422
3005	NC_020834	ATT	2	6	180235	180240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335422
3006	NC_020834	ATT	2	6	180294	180299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335422
3007	NC_020834	CAA	2	6	180315	180320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335422
3008	NC_020834	GTG	2	6	180337	180342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335422
3009	NC_020834	CGTG	2	8	180364	180371	0 %	25 %	50 %	25 %	472335422
3010	NC_020834	CGCC	2	8	180417	180424	0 %	0 %	25 %	75 %	472335422
3011	NC_020834	GTGC	2	8	180457	180464	0 %	25 %	50 %	25 %	472335422
3012	NC_020834	CAG	2	6	180590	180595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335422
3013	NC_020834	CTT	2	6	180714	180719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335422
3014	NC_020834	AGA	2	6	180741	180746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335422
3015	NC_020834	CAATAA	2	12	180829	180840	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	472335422
3016	NC_020834	ATT	2	6	180938	180943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335423
3017	NC_020834	TAC	2	6	180998	181003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
3018	NC_020834	TGC	2	6	181013	181018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335423
3019	NC_020834	TTA	2	6	181024	181029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335423
3020	NC_020834	TAT	2	6	181082	181087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335423
3021	NC_020834	TGG	2	6	181127	181132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335423
3022	NC_020834	ATA	2	6	181171	181176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335423
3023	NC_020834	TAC	2	6	181196	181201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
3024	NC_020834	AGC	2	6	181237	181242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335423
3025	NC_020834	GTT	2	6	181276	181281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335423
3026	NC_020834	TCA	2	6	181369	181374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
3027	NC_020834	ACA	2	6	181399	181404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335423
3028	NC_020834	CAGAGG	2	12	181487	181498	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	472335423
3029	NC_020834	ATC	2	6	181527	181532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
3030	NC_020834	TAGACC	2	12	181539	181550	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472335423
3031	NC_020834	CTT	2	6	181604	181609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335423
3032	NC_020834	TGC	2	6	181632	181637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335423
3033	NC_020834	T	6	6	181655	181660	0 %	100 %	0 %	0 %	472335423
3034	NC_020834	AT	3	6	181688	181693	50 %	50 %	0 %	0 %	472335423
3035	NC_020834	AGT	2	6	181722	181727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335423
3036	NC_020834	T	7	7	181774	181780	0 %	100 %	0 %	0 %	472335423
3037	NC_020834	AGAC	2	8	181889	181896	50 %	0 %	25 %	25 %	472335423
3038	NC_020834	TAGCTT	2	12	181916	181927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	472335423
3039	NC_020834	T	6	6	181951	181956	0 %	100 %	0 %	0 %	472335423
3040	NC_020834	CCA	2	6	181969	181974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335423
3041	NC_020834	GCC	2	6	182005	182010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335423
3042	NC_020834	TCCCA	2	10	182049	182058	20 %	20 %	0 %	60 %	472335423
3043	NC_020834	TCA	2	6	182063	182068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335423
3044	NC_020834	GA	3	6	182145	182150	50 %	0 %	50 %	0 %	472335423
3045	NC_020834	TTA	2	6	182251	182256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335424
3046	NC_020834	ATA	2	6	182286	182291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3047	NC_020834	ATA	3	9	182306	182314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3048	NC_020834	AAT	2	6	182339	182344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3049	NC_020834	CAG	2	6	182461	182466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335424
3050	NC_020834	GATT	2	8	182505	182512	25 %	50 %	25 %	0 %	472335424
3051	NC_020834	T	6	6	182511	182516	0 %	100 %	0 %	0 %	472335424
3052	NC_020834	TAA	2	6	182533	182538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3053	NC_020834	TCA	2	6	182544	182549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335424
3054	NC_020834	CTT	2	6	182712	182717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335424
3055	NC_020834	A	9	9	182751	182759	100 %	0 %	0 %	0 %	472335424
3056	NC_020834	TAA	2	6	182763	182768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3057	NC_020834	GC	3	6	182812	182817	0 %	0 %	50 %	50 %	472335424
3058	NC_020834	AAG	2	6	182876	182881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335424
3059	NC_020834	ATG	2	6	182912	182917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335424
3060	NC_020834	AGG	2	6	182941	182946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335424
3061	NC_020834	GGC	2	6	182998	183003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335424
3062	NC_020834	AG	3	6	183121	183126	50 %	0 %	50 %	0 %	472335424
3063	NC_020834	AAG	2	6	183151	183156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335424
3064	NC_020834	AGG	2	6	183159	183164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472335424
3065	NC_020834	AAAC	2	8	183192	183199	75 %	0 %	0 %	25 %	472335424
3066	NC_020834	ATA	2	6	183215	183220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3067	NC_020834	TAA	2	6	183270	183275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3068	NC_020834	ATA	2	6	183359	183364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335424
3069	NC_020834	GAA	2	6	183365	183370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335424
3070	NC_020834	TGCC	2	8	183423	183430	0 %	25 %	25 %	50 %	472335424
3071	NC_020834	TTG	2	6	183486	183491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335424
3072	NC_020834	CAAA	2	8	183670	183677	75 %	0 %	0 %	25 %	472335425
3073	NC_020834	AGA	2	6	183679	183684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335425
3074	NC_020834	GT	3	6	183720	183725	0 %	50 %	50 %	0 %	472335425
3075	NC_020834	TTC	2	6	183758	183763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335425
3076	NC_020834	TAA	2	6	183784	183789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335425
3077	NC_020834	TAAATT	2	12	183866	183877	50 %	50 %	0 %	0 %	472335425
3078	NC_020834	AAT	2	6	183885	183890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335425
3079	NC_020834	ATA	3	9	183915	183923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335425
3080	NC_020834	GTG	2	6	183927	183932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335425
3081	NC_020834	ATG	2	6	184061	184066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335425
3082	NC_020834	TAA	2	6	184081	184086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335425
3083	NC_020834	AATG	2	8	184107	184114	50 %	25 %	25 %	0 %	472335425
3084	NC_020834	ACC	2	6	184119	184124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335425
3085	NC_020834	TAA	2	6	184139	184144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335425
3086	NC_020834	TTTA	2	8	184482	184489	25 %	75 %	0 %	0 %	472335426
3087	NC_020834	GAGT	2	8	184508	184515	25 %	25 %	50 %	0 %	472335426
3088	NC_020834	TTA	2	6	184580	184585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335426
3089	NC_020834	AAG	2	6	184628	184633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335426
3090	NC_020834	TGAA	2	8	184661	184668	50 %	25 %	25 %	0 %	472335426
3091	NC_020834	GCGT	2	8	184721	184728	0 %	25 %	50 %	25 %	472335426
3092	NC_020834	CAA	2	6	184843	184848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335427
3093	NC_020834	GAGC	2	8	184935	184942	25 %	0 %	50 %	25 %	472335427
3094	NC_020834	T	6	6	184943	184948	0 %	100 %	0 %	0 %	472335427
3095	NC_020834	AAGCCA	2	12	185007	185018	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	472335427
3096	NC_020834	TGG	2	6	185057	185062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335427
3097	NC_020834	TGA	2	6	185208	185213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335427
3098	NC_020834	GAT	2	6	185238	185243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335427
3099	NC_020834	GAA	2	6	185499	185504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335427
3100	NC_020834	ATT	2	6	185613	185618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335427
3101	NC_020834	TAG	2	6	185625	185630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335427
3102	NC_020834	CCA	2	6	185636	185641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335427
3103	NC_020834	CCCA	2	8	185696	185703	25 %	0 %	0 %	75 %	472335427
3104	NC_020834	AGA	2	6	185762	185767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335428
3105	NC_020834	ACT	2	6	185794	185799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335428
3106	NC_020834	AAAG	2	8	185832	185839	75 %	0 %	25 %	0 %	472335428
3107	NC_020834	T	6	6	185879	185884	0 %	100 %	0 %	0 %	472335428
3108	NC_020834	TCA	2	6	185908	185913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335428
3109	NC_020834	T	6	6	185928	185933	0 %	100 %	0 %	0 %	472335428
3110	NC_020834	TC	3	6	185967	185972	0 %	50 %	0 %	50 %	472335428
3111	NC_020834	GAT	2	6	186045	186050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335428
3112	NC_020834	ATA	2	6	186079	186084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335428
3113	NC_020834	ATA	2	6	186097	186102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335428
3114	NC_020834	ATTT	2	8	186601	186608	25 %	75 %	0 %	0 %	472335429
3115	NC_020834	TGG	2	6	186637	186642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335429
3116	NC_020834	TTG	2	6	186699	186704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335429
3117	NC_020834	CAA	2	6	186809	186814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335429
3118	NC_020834	AATC	2	8	186842	186849	50 %	25 %	0 %	25 %	472335429
3119	NC_020834	TTC	2	6	186897	186902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335429
3120	NC_020834	T	7	7	186940	186946	0 %	100 %	0 %	0 %	472335429
3121	NC_020834	TTGCCG	2	12	187036	187047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335429
3122	NC_020834	T	6	6	187078	187083	0 %	100 %	0 %	0 %	472335429
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3229	NC_020834	ATC	2	6	192557	192562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335437
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3231	NC_020834	TCA	2	6	192603	192608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335437
3232	NC_020834	CTT	2	6	192637	192642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335437
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3234	NC_020834	GCCA	2	8	192765	192772	25 %	0 %	25 %	50 %	472335437
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3236	NC_020834	GTTT	2	8	192882	192889	0 %	75 %	25 %	0 %	472335438
3237	NC_020834	TTCT	2	8	192890	192897	0 %	75 %	0 %	25 %	472335438
3238	NC_020834	ACC	2	6	192905	192910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335438
3239	NC_020834	AATTAA	2	12	192925	192936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335438
3240	NC_020834	CATAA	2	10	192947	192956	60 %	20 %	0 %	20 %	472335438
3241	NC_020834	CCA	2	6	193020	193025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335438
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3243	NC_020834	AGC	2	6	193207	193212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335438
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3371	NC_020834	AAT	2	6	200923	200928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335444
3372	NC_020834	CTA	2	6	201009	201014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335444
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3374	NC_020834	GCG	2	6	201119	201124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335444
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3491	NC_020834	GACC	2	8	207733	207740	25 %	0 %	25 %	50 %	472335453
3492	NC_020834	TGC	2	6	207742	207747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335453
3493	NC_020834	CGG	2	6	207763	207768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335453
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3499	NC_020834	CAG	2	6	208162	208167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335454
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